Fort Myers Beach situa-se no extremo oeste da Estero Bay Aquatic Preserve, um sistema de estuário de 15.000 acres designado como protegido em 1966 e que abriga mais de 220 espécies de aves, golfinhos-nariz-de-garrafa, peixes-boi das Índias Ocidentais e florestas de mangue-vermelho que formam túneis e datam de séculos antes da colonização europeia. As ilhas de barreira e os riachos de maré que definem este trecho da Costa do Golfo da Flórida criam uma zona de transição salobra onde as zonas úmidas de água doce encontram o Golfo aberto, produzindo uma das maiores concentrações de biodiversidade marinha por milha quadrada nos Estados Unidos continentais. Ao contrário da remada em águas abertas, os túneis de mangue que atravessam Estero Island e Mound Key oferecem corredores navegáveis protegidos do vento e do sol, com seus sistemas de raízes arqueadas estabilizando a linha costeira e servindo como habitat de berçário para robalos juvenis, peixes-vermelhos e trutas marinhas. O acesso de caiaque a esses habitats tornou-se comercialmente viável no final da década de 1990, quando caiaques recreativos sit-on-top e modelos de turismo leves substituíram as pesadas canoas de madeira escavada usadas pelos pescadores Calusa por milênios. Hoje, passeios guiados partem de pontos de lançamento ao longo da Connecticut Street, Lovers Key State Park e as águas interiores de Matanzas Pass, cada rota calibrada para as janelas de maré que maximizam os avistamentos de vida selvagem e minimizam a resistência da corrente. As partidas matinais entre 9:00 e 11:00 alinham-se com os padrões de alimentação dos golfinhos e temperaturas ambientes mais frescas; as temperaturas da água no verão na baía podem exceder 31°C ao meio-dia, reduzindo a atividade de superfície dos mamíferos marinhos. O Mound House Archaeological Park, localizado na 451 Connecticut Street, serve tanto como um ponto de referência cultural quanto como um centro interpretativo ecológico para remadores que exploram os sambaquis pré-históricos da ilha. Os montes de conchas de ostra do local elevam-se 12 pés acima do nível do mar, evidência de ocupação Calusa sustentada de 50 a 1750 d.C., e o acesso direto ao estuário da propriedade torna-o uma área de preparação natural para passeios que incorporam tanto a história natural quanto o contexto indígena. Vários operadores oferecem agora caiaques com fundo transparente, permitindo a observação em tempo real de bancos de ervas marinhas, caranguejos-ferradura e arraias sem a necessidade de submersão. Os passeios de caiaque em Fort Myers Beach concentram-se em rotas de água salgada que maximizam a probabilidade de encontro, respeitando as regulamentações federais de aproximação a mamíferos marinhos. Os guias carregam hidrofones para detectar vocalizações de peixes-boi e mantêm distâncias mínimas de 50 pés de animais em repouso, de acordo com as diretrizes da NOAA aplicadas durante todo o ano nessas águas. O calado raso do estuário — com média de quatro a seis pés na maré alta — permite condições de remada estáveis para caiaquistas iniciantes, oferecendo profundidade suficiente para que a grande fauna marinha se mova livremente entre as zonas de alimentação e descanso.